中国中医科学院中医临床基础医学研究所（中国中医科学院中医药标准研究中心）成立于2006年4月，是在国家科技体制改革的总体要求和部署下，由科技部、财政部、中央编办批准的中国中医科学院下属的非盈利社会公益类科研事业单位。

　　重点工作包括：中医药临床标准共性技术研究，中医诊疗规范研究，中医临床评价研究，中药疗效评价研究，中医临床药理研究，中医预防康复医学基础研究，中医疫病防治基础研究、中医药文化宣传等。现为国家中医药管理局中医药标准化工作办公室挂靠单位、国际标准化组织中医药技术委员会（ISO/TC249）国内技术对口单位，中国中医药循证医学中心挂靠单位，中国标准化协会中医药分会、世界中医药联合会上市后中药再评价专业委员会、中国中医药信息研究会临床研究分会挂靠单位，承担国家中医药管理局中医药行业科研专项和国际合作专项办公室、中医药健康旅游示范区（基地、项目）管理办公室的工作。

　　建所以来，在所长王永炎院士的带领下，坚持“兼容并蓄、我主人随、求异求真”的发展理念，围绕中医药标准化、中医评价与循证研究、中医药疫病防治、中医心理学叙事医学及中医药文化建设等方向，先后承担国家科技支撑项目、973项目、863项目、行业专项、国家自然科学基金、国家出版基金、文化项目等国家级项目27项，发表学术论文1300余篇，其中 SCI收录240篇、12篇论文入选科技部“领跑者5000-中国精品科技期刊顶尖学术论文”，出版学术专著121部（册），获得专利17项、软件著作权28项，发布团体标准10项。获得国家科学技术进步奖5项，其中参与“我国首次对甲流H1N1流感大流行有效防控及集成创新性研究”获2014年国家科技进步一等奖；获得省部级科技奖励17项；获得院级科技奖励8项。